Revista Mexicana
de Fitopatología

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Caracterización del viroma en haba: Primera detección de Potyvirus phaseoluteum y Orthotospovirus impatiensnecromaculae en Montecillo, Texcoco, México

por Erick Ortega Piña, Daniel Leobardo Ochoa Martínez*, Reyna Isabel Rojas Martínez, Alfredo Díaz Lara

* Autor de Correspondencia. Correo electrónico: ldaniel@colpos.mx / Institución: Colegio de Postgraduados

Aceptado: 12/8/2024 – Publicado: 26/7/2024 – DOI: https://doi.org/10.18781/R.MEX.FIT.2402-8

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Resumen Antecedentes/Objetivo. En cultivos de haba (Vicia faba) establecidos en Montecillo, Texcoco, Estado de México se observó un 100 % de plantas con síntomas de virosis consistentes en mosaico, moteado, enrollamiento de hojas, marchitamiento y un decremento notable en el desarrollo de las plantas. Estos síntomas condujeron a una reducción significativa en el rendimiento y calidad de las semillas. En este contexto, se realizó el presente estudio con el objetivo de identificar las especies virales asociadas con estos síntomas.

Materiales y Métodos. La estrategia experimental consistió en extracción de ARN total de hojas manifestando los síntomas mencionados, seguido de secuenciación de nueva generación.

Resultados. En los resultados se obtuvieron los genomas completos de Orthotospovirus impatiensnecromaculae (antes impatiens necrotic spot virus) y de dos aislamientos del Potyvirus phaseoluteum (antes bean yellow mosaic virus). El análisis filogenético reveló que el aislamiento de O. impatiensnecromaculae (INSV CPMEX) muestra divergencias significativas respecto a los previamente reportados en otras especies vegetales. Por otro lado, los dos aislamientos de P. phaseoluteum (BYMV CP1MEX y BYMV CP2MEX) demostraron ser distintos entre sí, estando relacionados con aislamientos reportados en Sudán e Irán.

Conclusión. Este hallazgo sugiere una diversidad genética considerable entre los virus asociados a los síntomas de virosis en cultivos de haba en la región, lo que subraya la importancia de una identificación precisa para el manejo y control de estas infecciones virales

Palabras clave: Secuenciación de nueva generación, Potyvirus, Orthotospovirus, RNA, mosaico, moteado, divergencia viral

Cuadro 1. Cebadores diseñados para la corroboración de la presencia de Potyvirus phaseoluteum (Pp) y Orthotospovirus impatiensnecromaculae (Oi) en tejido foliar de haba con síntomas de mosaico, moteado, enrollamiento foliar, marchitamiento y disminución del crecimiento

Figura 1. Detección de Orthotospovirus impatiensnecromaculae y Potyvirus phaseoluteum en plantas de haba mediante RT-PCR. A) Producto de RT-PCR de un fragmento de 438 pb del segmento L que codifica la replicasa viral de O. impatiensne cromaculae: MPM= Marcador de peso molecular 100 pb PROMEGA, control negativo (-). Carriles 1, 3, 4, 9, 10, 13, 14 y 15 muestras de plantas de haba con síntomas de mosaico, moteado, enrollamiento y marchitamiento. B) Producto de RT-PCR de un fragmento de 319 pb del ORF del P. phaseoluteum que codifica para la nucleocápside: MPM= Marcador de peso molecular 100 pb PROMEGA, control negativo (-). Carriles 1, 2, 3, 4, 9, 10, 13, 14 y 15 plantas de haba con síntomas de mosaico, moteado, enrollamiento y marchitamiento. Las secuencias de los amplicones obtenidos tuvieron un 99% de cobertura y 99 % de identidad con aislados de P. phaseoluteum y O. impatiensnecromaculae depositados en el GenBank, respectivamente

Figura 2. Árbol filogenético de los aislados de Potyvirus phaseoluteum CP1MEX y BYMV CP2MEX utilizando el modelo General-Time-Reversible y el método de máxima verosimilitud con 500 repeticiones de bootstrap.